Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms