Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms