Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXP28300 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXP28300 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXP28300 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms