Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms