Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA5P28066 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA5P28066 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms