Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPREP23469 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPREP23469 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPREP23469 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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