Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT1P21579 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT1P21579 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT1P21579 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT1P21579 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms