Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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