Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms