Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms