Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms