Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms