Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms