Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PKHD1P08F94 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PKHD1P08F94 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PKHD1P08F94 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PKHD1P08F94 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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