Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPBP07199 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPBP07199 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms