Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFLP07196 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms