Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms