Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDN1P05305 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDN1P05305 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDN1P05305 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDN1P05305 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDN1P05305 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EDN1P05305 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDN1P05305 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDN1P05305 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDN1P05305 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms