Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHDP01880 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHDP01880 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHDP01880 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHDP01880 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHDP01880 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms