Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNKO75909 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCNKO75909 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms