Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAMP4O75379 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms