Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms