Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L1O75177 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms