Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNCRIPO60506 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms