Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms