Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC9O14530 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC9O14530 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms