Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBAG9O00559 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms