Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms