Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DLN1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DLN1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DLN1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DLN1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DLN1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DLN1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DLN1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms