Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms