Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms