Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT87PA6NCN2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms