Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms