Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPDC1A2A3K4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms