Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms