Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP3Q9Y6F1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms