Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX11Q9Y5W9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms