Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNPO3Q9Y5L0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms