Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms