Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2J1Q9Y385 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms