Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms