Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK2Q9UPX8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK2Q9UPX8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms