Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms