Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms