Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS4AQ9UN37 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms