Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PADI1Q9ULC6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms