Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXL4Q9UKA2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms