Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFDP1Q9UEE9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms