Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFIP11Q9UBB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms