Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms